Sein Schiff wird im All treibend gefunden und er allein wieder zum Leben erweckt. Unter dem Tarnnamen John Harrison versucht Khan Noonien Singh seine Gefährten aus alter Zeit zu retten und muss sich doch auf ein gefährliches Spiel mit Admiral Marcus einlassen. Dabei trifft er auch auf die junge Historikerin Marla McGivers. (Star Trek: Into Darkness-Prequel)

Die Enterprise ist zu ihrer Fünf-Jahres-Mission aufgebrochen. Zeit also, um voller Neugier und Hoffnung nach vorne zu blicken und alles zu vergessen, was in der letzten Zeit geschehen ist. Doch die Schatten der jüngeren Vergangenheit scheinen James T. Kirk und seine Crew einfach nicht loszulassen zu wollen. Kurz vor dem Verlassen des Förderationsraums wird der junge Captain mit dem düsteren Geheimnis einer Yeoman und einer völlig unerwarteten Bedrohung konfrontiert und nun muss sich beweisen, wie gut Spock, Pille und er zusammenhalten ...