Botschafter Spock ist im Jahr 2258 in einer alternativen Realität gestrandet. Sein Quallenschiff musste geopfert werden, um die Bedrohung von Nero zu neutralisieren, was allerdings zur Folge hatte, dass es für Spock keinen Weg zurück in sein Universum und seine Zeit gibt.

Die Ereignisse von Genesis haben ihre Spuren hinterlassen. Mit ihnen beginnt für Kirk, McCoy, Spock und Saavik ein neuer Abschnitt in ihrem Leben. Vor allem für Spock bedeuten die Ereignisse eine Wende.