Die Enterprise bringt Hilfsgüter zu einem Planeten. Dass sie dabei dicht an der neutralen Zone vorbeifliegt, ruft einige Probleme und einen unbekannten Attentäter auf den Plan.

Eine Grippewelle setzt mehr als die Hälfte der Besatzung der Enterprise außer Gefecht. Die erkrankten Crewmitglieder werden trotz der Behandlung mit Medikamenten nicht gesund. Was ist die Ursache?

Khan ist auf der Enterprise angekommen und stürzt sich mit der restlichen Crew in ein Abenteuer, das offenbart, wie das Universum wirklich entstanden ist und dass ein heimtückischer Schachzug, alles verändern kann.

Khan ist auf der Enterprise angekommen. Aber einige Dinge neben seinem neuen Job als Sicherheitsoffizier verlangen nach Aufmerksamkeit und er kann sich letzendlich nicht so gut darauf konzentrieren wie er es eigentlich vorhatte...

Khan ist auf die Enterprise gekommen, doch Admiral Marcus ist ihm dicht auf den Fersen...

Leonard mag eigentlich seit seiner Scheidung keine Frauen mehr (außer Joanna und Elenora) ,aber als bei den Mc Coys ein bezauberndes Wesen des anderen Geschlechts auftaucht ,wird Bones eines besseren belehrt...

Als die Crew der Bottany Bay vernichtet werden soll, um etwaigen Fehlern in der Zukunft auszuweichen, rettet Commander Counter die Krypto-Zelle des gefürchteten John Harrison.
Nach einem Jahr dient Commander Harrison auf der Enterprise, und jeder macht sich Sorgen. Ist er ein Verräter, der nur wieder versucht, die Kontrolle an sich zu reißen und die Sternenflotte zu vernichten?
Doch es ergeben sich andere Probleme: Nachdem ein Außentrupp der Enterprise, unter ihnen Commander Counter und Commander Harrison, verschwunden ist wurde die Sternenflotte infiltriert. Von wem oder was, weiß einer. Und nur Jean scheint die Wahrheit zu erkennen, doch ohne Counters Hilfe scheint es, wie ein Kampf gegen Windmühlen.

Aufgrund eines Notrufs machen sich James T. Kirk und Spock auf den Weg zu einer kollabierenden vulkanischen Raumstation. Kurz darauf bekommen sie einen weiteren Notruf; diesmal vom neuen Heimatplaneten der Vulkanier: Neo-Vulkan. Ein tödliches Virus soll dort ausgebrochen sein, der gleiche wie auf der Raumstation. Und als Spock infiziert wird, wird nicht nur Kirk klar: Es ist definitiv kein Zufall, dass es nur die Vulkanier verseucht. Nur zu dumm, dass er sich in die Gelegenheit anderer mischt...

Als die Crew der Enterprise nach den Ereignissen von Into Darkness auf einem Wüstenplanet mehr oder weniger freiwillig eine fremde Person aufsammelt, ahnt keiner der Anwesenden, was für weitreichende Folgen diese Begegnung haben wird ...

Die Geschichte, die sich vor achtundzwanzig Jahren abgespielt hatte, wiederholt sich auf eine andere Weise erneut. Der Captain geht mit seinem Schiff unter und der erste Offizier mit ihm. Zwei Entscheidungen, die alles verändern. Und daran ist nur ein gefürchteter Nebel namens "Vashta Nerada" schuld.