Als die Crew der Bottany Bay vernichtet werden soll, um etwaigen Fehlern in der Zukunft auszuweichen, rettet Commander Counter die Krypto-Zelle des gefürchteten John Harrison.
Nach einem Jahr dient Commander Harrison auf der Enterprise, und jeder macht sich Sorgen. Ist er ein Verräter, der nur wieder versucht, die Kontrolle an sich zu reißen und die Sternenflotte zu vernichten?
Doch es ergeben sich andere Probleme: Nachdem ein Außentrupp der Enterprise, unter ihnen Commander Counter und Commander Harrison, verschwunden ist wurde die Sternenflotte infiltriert. Von wem oder was, weiß einer. Und nur Jean scheint die Wahrheit zu erkennen, doch ohne Counters Hilfe scheint es, wie ein Kampf gegen Windmühlen.

Aufgrund eines Notrufs machen sich James T. Kirk und Spock auf den Weg zu einer kollabierenden vulkanischen Raumstation. Kurz darauf bekommen sie einen weiteren Notruf; diesmal vom neuen Heimatplaneten der Vulkanier: Neo-Vulkan. Ein tödliches Virus soll dort ausgebrochen sein, der gleiche wie auf der Raumstation. Und als Spock infiziert wird, wird nicht nur Kirk klar: Es ist definitiv kein Zufall, dass es nur die Vulkanier verseucht. Nur zu dumm, dass er sich in die Gelegenheit anderer mischt...

Als die Crew der Enterprise nach den Ereignissen von Into Darkness auf einem Wüstenplanet mehr oder weniger freiwillig eine fremde Person aufsammelt, ahnt keiner der Anwesenden, was für weitreichende Folgen diese Begegnung haben wird ...

Die Enterprise ist unterwegs zu einer Raumbasis, damit die Crew ihren wohlverdienten Urlaub antreten kann. Doch auf einmal überschlagen sich die Ereignisse: Das Raumschiff wird stark beschädigt und Captain Kirk strandet mit seiner Crew auf einem unerforschten Planeten. Außerdem scheinen er und seine Freunde von einer unheimlichen Macht heimgesucht zu werden...

Die Voyager stößt auf eine Spezies, bei der Frauen keinerlei Rechte haben. Dies zieht eine temporäre Veränderungen der gesamten Kommandostruktur des Schiffs nach sich und hält für einige Besatzungsmitglieder unliebsame Überraschungen bereit.

"The Depths of Space" erzählt die Geschichte der U.S.S. Sheffield und ihrer Besatzung. Das Schiff von der Ersatzbank und seine Mannschaft aus zweiter Hand werden auf ihrer ersten Reise hart geprüft und die Crew muss schneller zusammenwachsen, als sie es erwartet hätte.

Zarial beobachtete die Schneeflocken dabei, wie sie langsam zu Boden schwebten und auf dem kalten, schwarzen Felsgestein liegen blieben. Während seines beschwerlichen Weges hatte er in den letzten Tagen reichlich Schnee gesehen. Aber jetzt, wo er sein Ziel fast erreicht hatte, sah er erstmals, wie Schneeflocken vom Himmel über Kronos fielen.
Er hatte ganz vergessen, wie schön dieser Anblick war. Wenn er darüber nachdachte, wo er sich in den letzten Jahren überall aufgehalten hatte – auf einem luftlosen Asteroiden, in einem tagusianischen Dschungel und einer vulkanischen Wüste – verwunderte ihn das auch gar nicht.

Kortars Stimme erreichte ungeahnte Tiefen, als er das Lied der Erkenntnis anstimmte und das Schwert besang, das er soeben geschmiedet hatte. Obwohl es seine Götter verboten hatten, hatte es Kortar gewagt einen Gegenstand zu erschaffen, mit dem sich töten ließ. Ein unsagbares Sakrileg in der Ersten Zeit.

McCoy wird auf Deneva geschickt, um eine sich ausbreitende Persönlichkeitsstörung zu untersuchen. Während er auf George Kirk stößt, greifen die Romulaner an, welche auf Spocks Auslieferung bestehen.

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