„Wenn der Frieden in Gefahr ist, kann man es sich manchmal einfach nicht mehr leisten Pazifist zu sein. Doch die Definition von Terrorismus liegt immer im Auge des Betrachters.“ –– Weil sie ihre Heimat gegen Ungerechtigkeiten und politische Intrigen verteidigen, werden sie von der Föderation als Terroristen angesehen. Sie selbst jedoch sehen sich als Widerstandskämpfer und Rebellen, die nur ihr Leben und ihre Rechte zurück wollen. Dies ist eine Vorgeschichte zu Star Trek Voyager, erzählt aus der Perspektive der Maquis-Anführerin Consuelo Indurain, zu deren Widerstandsbewegung auch Chakotay, B’Elanna Torres, Miguel Ayala, Seska, und der Rest der Maquis von der Voyager gehören ...

Im Gamma-Quadranten unterwegs, gerät das Shuttle plötzlich in einen Ionensturm. Jadzia Dax, Garak und Quark sind daher gezwungen auf einem fremden Planeten zu landen, wo sie mitten in einen Freiheitskampf der Einheimischen gegen einen skrupellosen Landlord geraten.

Vedek Bareil ist in den Zarai-Bergen auf Bajor verschollen. In einer mysteriösen Nachricht bittet einer seiner Begleiter Lieutenant Jadzia Dax um Hilfe. Diese macht sich gemeinsam mit Major Kira Nerys auf den Weg in diese geheimnisumwobenen Berge, deren starker Magnetismus jede Kommunikation unmöglich macht.

Sisko schloss die Augen, ehe die verheerende Energie die Defiant traf und sie in die Dunkelheit schleuderte, in das Vergessen.

Captain Siskos Auftrag ist es, den Abflug eines veranischen Frachters unauffällig hinauszuzögern, um herauszufinden, welche Art von militärischen Geheimnissen er in den Gamma-Quadranten schmuggeln möchte.
Die Aufgabe erweist sich als unerwartet kompliziert, als sich herausstellt, dass der Pilot ein alter Kindheitsfreund des Captains ist und Siskos Objektivität zu schwanken beginnt.

Kira wird von Dr. Bashir zwangsbeurlaubt und beschließt, den Weg der Reinigung durch die Wüste von Kanaan zu gehen. Dabei erhält sie unerwartete Gesellschaft und es ist fraglich, ob die Reise so erholsam wie geplant wird. Kira und Dax müssen erkennen, dass die Wüste nicht nur von bizarrer Schönheit ist, sondern auch voller Gefahr.

Dax wird Zeuge eines Kampfes zwischen Jem’Hadar Schiffen und einem klingonischen Bird of Prey. Natürlich kann sie sich wider besseren Wissens nicht heraushalten und findet sich in einer Situation wieder, in welcher sie mit der Klingonin Grilka zusammen arbeiten muss, um aus einer dominischen Inhaftierungszelle zu entfliehen.

Q schenkt Quark einen Gegenstand, mit dessen Hilfe die geheimsten Träume des Ferengi wahr werden können.

Ein Jahr, nachdem sie Jadzia Dax den Rücken gekehrt hat, kommt Lenara Kahn nach DS9 zurück – nur um festzustellen, dass ihre große Liebe bereits vergeben ist. In ihrer Einsamkeit findet sie im Dabomädchen Leeta eine unerwartete Freundin.