Als die Voyager heimkehrt ist der Alphaquadrant allen fremd geworden. Die Mannschaft wird auseinandergerissen und bleibt sich trotzdem immer verbunden – nach und nach bauen sie sich alle ein neues Leben auf, die Marshauptstadt Utopia Planitia wird zur Heimat einer immer größer und chaotischer werdenden Patchwork-Familie an Voyagers. Unter dem Projektnamen Pioneer und Admiral Kathryn Janeways Führung wird emsig an den mitgebrachten Technologien aus dem Deltaquadranten geforscht und gearbeitet, denn ihr erklärtes gemeinsames Ziel ist es, die Galaxie durch verbesserte Schiffssysteme näher zusammenzubringen und letzten Endes in den Deltaquadranten zurückkehren zu können. Und gerade als alles richtig gut zu laufen scheint passiert das Unvorstellbare und nichts wird je wieder so sein wie es einmal war. Einfach aufzugeben kommt trotz des enormen Rückschlags und der persönlichen Verluste nicht in Frage, denn das Motto des Pioneer-Projekts lautet “Hoffnung, Ambition, Neugier” und für Neugier gibt es keine Heilung, sagt Commander Annika Barclay und beginnt die Trümmer des Pioneer-Projekts und ihres Lebens wieder zusammenzusetzen.

„Wenn der Frieden in Gefahr ist, kann man es sich manchmal einfach nicht mehr leisten Pazifist zu sein. Doch die Definition von Terrorismus liegt immer im Auge des Betrachters.“ –– Weil sie ihre Heimat gegen Ungerechtigkeiten und politische Intrigen verteidigen, werden sie von der Föderation als Terroristen angesehen. Sie selbst jedoch sehen sich als Widerstandskämpfer und Rebellen, die nur ihr Leben und ihre Rechte zurück wollen. Dies ist eine Vorgeschichte zu Star Trek Voyager, erzählt aus der Perspektive der Maquis-Anführerin Consuelo Indurain, zu deren Widerstandsbewegung auch Chakotay, B’Elanna Torres, Miguel Ayala, Seska, und der Rest der Maquis von der Voyager gehören ...

Janeway, Picard und O’Brien wurden eingeladen das Weihnachtsfest auf DS9 zu verbringen.

Es sind Tage wie diese, die unser Leben für immer verändern. Die Voyager ist aus dem Deltaquadranten zurückgekehrt und plötzlich geht es im Hauptquartier des Pathfinder-Projekts drunter und drüber, denn damit hätte wirklich niemand gerechnet. Und währenddessen muss sich die Mannschaft der Voyager auf ein neues Leben und eine ungewisse Zukunft in der fremdgewordenen Heimat vorbereiten. [Sequel zu „Star Trek Voyager: Endgame“, Prequel zu „Voyagers & Wayfarers“.]

Die Crew der Voyager stößt auf einen verlassenen Raumschifffriedhof. Tom Paris ist begeistert, hofft er doch, einige Zusätze für den Deltaflyer zu finden. B’Elanna Torres hingegen hofft auf einige Teile für die Voyager und Dilithium, das vorhanden sein könnte. In der Beziehung der beiden Lieutenants rieselt es seit einiger Zeit beständig und das belastet die gesamte Crew. Auch die ungeklärten Ereignisse zwischen dem Kommandoduo sorgen für Reibereien und als Captain Janeway von der Vergangenheit eingeholt wird, ist das Chaos perfekt. Kathryn steht vor einer Entscheidung – Verzeiht sie oder geht sie freiwillig in den Tod? [Stargäste: Admiral Edward Janeway &' Captain Justin Thige]

Die USS Voyager passiert einen Nebel und findet sich kurz darauf in einem Paralelluniversum wieder, in dem Commander Chakotay der kommandierende Offizier der Voyager ist. Captain Janeway ist verschwunden. Die Crew der USS Voyager startet die Suche nach ihrem Captain, doch diese gestaltet sich als schwierig, denn Captain Janeway befindet sich in diesem Universum auf der Flucht vor der Sternenflotte und will nicht gefunden werden.

Fortsetzung zu 'Im Schatten der Vernichtung'. Im Delta-Quadranten spürt die Borg-Queen, dass im Alpha-Quadranten ein neues Borgkollektiv mit Kira als Herrscherin agiert. Sie bedient sich der Voyager und deren Besatzung, um zu ihrer verhassten Feindin zu gelangen.

Ein Blick ins Familienalbum: Jack Janeway und Marek Stermann stehen am Beginn ihrer Beziehung und sind fürchterlich nervös vor dem ersten Kennenlernen der Familie des anderen. (Beitrag zur 25er-Challenge, Stichwort "Musik")

Gestrandet ohne Crew entdeckt die Voyager ein uraltes Raumschiff von der Erde, welches damals einen neuen Antrieb zur Überwindung großer Strecken getestet hatte. Captain Janeway beamt sich mit einigen Mitgliedern ihrer Crew an Bord und muss feststellen, dass ihre schlimmsten Alpträume Wahrheit werden, als Seven in den Antrieb hineingezogen wird und die Schwelle zum Dunklen Horizont überschreitet.

Jadzia Dax und Will Riker geraten in das Spiegeluniversum. Dax wird für eine Spionin der Allianz gehalten und von den liebenden Armen der Intendantin empfangen. Will Riker hingegen wird als gesuchter Rebell vom bajoranischen Geheimdienst inhaftiert, dessen Chef hofft, mit Hilfe des verhassten Terraners an seine verlorene Liebe Ro Laren zu gelangen.